The molecular phylogeny of the genus Rhizopus based on rDNA sequences

Abe, Ayumi; Oda, Yuji; Asano, Kozo et al.

Bioscience Biotechnology and Biochemistry, 2006, 70(10), 2387-2393

Permalink : https://hdl.handle.net/2115/16008

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論文情報

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アクセス権
open access
URI
https://hdl.handle.net/2115/16008
タイトル
The molecular phylogeny of the genus Rhizopus based on rDNA sequences
著者
Abe, Ayumi ; Oda, Yuji ; Asano, Kozo ; Sone, Teruo
著者名
Abe, Ayumi
著者名
Oda, Yuji
e-Rad_Researcher
50312393
著者名
Asano, Kozo
e-Rad_Researcher
00333633
著者名
Sone, Teruo
言語
英語
キーワード
Rhizopus
ribosomal RNA-encoding DNA (rDNA)
classification
molecular phylogeny
発行日
2006-10
出版者
日本農芸化学会
Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
収録物名
Bioscience Biotechnology and Biochemistry
巻(号)
70(10)
ページ
2387-2393
抄録
In order to establish the molecular phylogeny of the genus Rhizopus, three molecules of the ribosomal RNA-encoding DNA (rDNA), complete 18S, internal transcribed spacer (ITS)1-5.8S-ITS2, and 28S D1/D2 regions of all the species of the genus were sequenced. Phylogenetic trees showed three major clusters corresponding to the three groups in the current morphological taxonomy, microsporus-group, stolonifer-group, and R. oryzae. R. stolonifer var. lyococcos was clustered independently from the major clusters. R. schipperae clustered differently in all trees. Strains of R. sexualis had multiple ITS sequences. A. rouxii clustered with R. oryzae. These results indicate the possibility of molecular identification of species groups using rDNA sequencing. Reclassification of the genus might be appropriate.
資源タイプ
学術雑誌論文
出版タイプ
Version of Record
PISSN
0916-8451
EISSN
1347-6947
関連情報
PMID
17031057
URI
http://www.jstage.jst.go.jp/
関連情報 (isIdenticalTo)
出版社版DOI
https://doi.org/10.1271/bbb.60101