An enhanced molecular marker based genetic map of perennial ryegrass (Lolium perenne) reveals comparative relationships with other Poaceae genomes

Jones, Elizabeth S.; Mahoney, Natalia L.; Hayward, Michael D.; Armstead, Ian P.; Jones, J. Gilbert; Humphreys, Mervyn O.; King, Ian P.; Kishida, Tsugutoshi; Yamada, Toshihiko; Balfourier, François; Charmet, Gilles; Forster, John W.

An enhanced molecular marker based genetic map of perennial ryegrass (Lolium perenne) reveals comparative relationships with other Poaceae genomes

Jones, Elizabeth S.; Mahoney, Natalia L.; Hayward, Michael D. et al.

Genome, 2002, 45(2), 282-295

Permalink : https://hdl.handle.net/2115/42623

このアイテムのアクセス数:1,232件（2026-02-18 20:39 集計）

閲覧可能ファイル

ファイル	フォーマット	サイズ	閲覧回数	説明
gen20	pdf	1.49 MB	2,451

論文情報

ファイル出力 EndNote Basic出力 Mendeley出力

アクセス権	open access
URI	https://hdl.handle.net/2115/42623
タイトル	An enhanced molecular marker based genetic map of perennial ryegrass (Lolium perenne) reveals comparative relationships with other Poaceae genomes
著者	Jones, Elizabeth S. ; Mahoney, Natalia L. ; Hayward, Michael D. ; Armstead, Ian P. ; Jones, J. Gilbert ; Humphreys, Mervyn O. ; King, Ian P. ; Kishida, Tsugutoshi ; Yamada, Toshihiko ; Balfourier, François ; Charmet, Gilles ; Forster, John W.
著者名 Jones, Elizabeth S.
著者名 Mahoney, Natalia L.
著者名 Hayward, Michael D.
著者名 Armstead, Ian P.
著者名 Jones, J. Gilbert
著者名 Humphreys, Mervyn O.
著者名 King, Ian P.
著者名 Kishida, Tsugutoshi
e-Rad_Researcher 70343952 著者名 Yamada, Toshihiko
著者名 Balfourier, François
著者名 Charmet, Gilles
著者名 Forster, John W.
言語	英語
キーワード	Lolium perenne
	genetic linkage map
	RFLP
	AFLP
	conserved synteny
	carte de liaison génétique
	conservation de la synténie
発行日	2002-04
出版者	National Research Council of Canada
収録物名	Genome
巻(号)	45(2)
ページ	282-295
抄録	A molecular-marker linkage map has been constructed for perennial ryegrass (Lolium perenne L.) using a one-way pseudo-testcross population based on the mating of a multiple heterozygous individual with a doubled haploid genotype. RFLP, AFLP, isoenzyme, and EST data from four collaborating laboratories within the International Lolium Genome Initiative were combined to produce an integrated genetic map containing 240 loci covering 811 cM on seven linkage groups. The map contained 124 codominant markers, of which 109 were heterologous anchor RFLP probes from wheat, barley, oat, and rice, allowing comparative relationships between perennial ryegrass and other Poaceae species to be inferred. The genetic maps of perennial ryegrass and the Triticeae cereals are highly conserved in terms of synteny and colinearity. This observation was supported by the general agreement of the syntenic relationships between perennial ryegrass, oat, and rice and those between the Triticeae and these species. A lower level of synteny and colinearity was observed between perennial ryegrass and oat compared with the Triticeae, despite the closer taxonomic affinity between these species. It is proposed that the linkage groups of perennial ryegrass be numbered in accordance with these syntenic relationships, to correspond to the homoeologous groups of the Triticeae cereals.
抄録	Une carte génétique composée de marqueurs moléculaires a été produite pour l'ivraie vivace (Lolium perenne L.) à l'aide d'une population issue d'un pseudo-testcross unidirectionnel. Les parents étaient, d'une part, un individu multiple hétérozygote et, d'autre part, un génotype haploïde doublé. Des données pour des marqueurs RFLP, AFLP, isoenzymatiques ainsi que des EST ont été contribuées par quatre laboratoires faisant partie du « International Lolium Genome Initiative (ILGI) ». Ces données ont été combinées pour produire une carte génétique intégrée comprenant 240 locus, formant sept groupes de liaison et s'étendant sur 811 cM. La carte compte 124 marqueurs codominants dont 169 sont des sondes-repères RFLP hétérologues provenant du blé, de l'orge, de l'avoine ou du riz. Ces sondes permettent d'examiner les relations entre l'ivraie vivace et d'autres espèces de graminées. Les cartes génétiques de l'ivraie vivace et des céréales de la tribu des hordées sont très conservées en termes de synténie et de colinéarité. Cette conclusion s'appuie sur une concordance générale au niveau des relations de synténie entre l'ivraie vivace, l'avoine et le riz ainsi qu'entre les hordées et ces espèces. Un plus faible niveau de synténie et de colinéarité a été observé entre l'ivraie vivace et l'avoine par rapport aux hordées, malgré la proximité taxinomique entre ces espèces. Il est suggéré que les groupes de liaison chez l'ivraie vivace soient numérotés en fonction des relations de synténie de façon à correspondre aux groupes d'homéologues chez les céréales.
資源タイプ	学術雑誌論文
出版タイプ	Version of Record
権利情報	© 2002 NRC Research Press
PISSN	0831-2796
EISSN	1480-3321
NCID	AA10737092
関連情報 (isIdenticalTo)	出版社版DOI https://doi.org/10.1139/G01-144