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# [drf:28] Fwd: 「XooNIps研究会第1回ワークショップ」の報告

- Date: Tue, 24 Jul 2007 08:39:42 +0900 (JST)

    件名: 「XooNIps研究会第1回ワークショップ」の報告
    日付: Sat, 21 Jul 2007 23:05:14 +0900
    送信者: "Shin_IRIE" <irie ＠ xxxxxxxxxxxxxx>
    宛先: csi-ir ＠ xxxxxxxxx, drf ＠ xxxxxxxxxxxxxxxxx

    >入江＠慶應です
    >みなさま
    >
    >７月１９日に行われました「XooNIps研究会第1回ワークショップ」の報告 をお
    >送りいたします。
    >
    >理化学研究所のニューロインフォマティックやゲノムの研究者と
    >大学図書館関係者がデジタルアーカイブ・リポジトリについて議論するという、
    >初めて会うグループ同士のワークショップで、話題がかみ合うのかとても
    >不安だったのですが、PubMed、メタデータ、収集するデジタルコンテンツの種類
    >と保存、研究成果の収集の難しさ、という共通用語が飛び交い、とても活発な議
    >論が交わされたワークショップでした。
    >また、図書館の可能性を感じることのできる時間でもありました。
    >資料は、後ほど　理化学研究所のサイトから公開される予定です。
    >来週は、27日に大阪ＷＳになります。
    >興味のあるかたはご参加ください。
    >
    >------
    >2007年7月19日、13:00から17:00まで理化学研究所RIBF棟2階の大会議室にて、
    >第1回目となるXooNIps研究会が開催された。出席者は、50名程度で、理研関係者
    >と図書館関係者が半々であった。活発な質疑応答があり、研究者と図書館との間
    >のコミュニケーションがうまく図られたワークショップであった。
    >
    >ワークショップの内容は以下の通り。
    >1. XooNIpsの開発経緯
    >非常に細かく分化している脳科学の各分野の研究データを集積し、脳を全体とし
    >て一つのシステムとして理解しようとするのがニューロインフォマティクスであ
    >る。この分野の研究には論文を読み、その中に記述されている最終的な実験結果
    >や一部の数式だけを理解するだけではなく、その執筆過程で開発・利用・作成さ
    >れたプログラムやシミュレータ、実験結果といった多種多様なデータを入手し、
    >そこから新たな成果を産み出すという積み重ねが有効である。しかし、今まで成
    >果として公開されるのは論文のみであり、そういったデータは公開されず、有効
    >利用できなかった。こういった過去のデータの集積、共有のための基盤システム
    >としてXooNIpsは開発されている。現在の採用機関としては、理研のBrain
    >Science Instituteの各ラボ、国際ニューロインフォマティクス統合機構
    >（ＩＮＣＦ：International Neuroinformatics Coordinating Facility）日本
    >ノードであるNIJC（神経情報基盤センター）の各プラットフォーム、機関リポジ
    >トリなどがある。
    >2. XooNIpsの紹介(機能概要)
    >XooNIpsの特徴は、データベース構築の柔軟さ、データの表現能力の高さ、ワー
    >クフローによる品質維持、メタデータの流通、多彩な補助機能の5つ。
    >3. XooNIps活用事例の紹介
    >① INCF日本ノード(J-Node)ポータルサイト
    >ＩＮＣＦにおいて、日本は最も進んでいる国の一つである。NIJCの下にある各プ
    >ラットフォームで、それぞれデータベース(XooNIps)が構築されている。共通基
    >盤技術のプラットフォームとして、XooNIpsの他に、SATEITE(システム解析支援
    >統合環境)や、Samurai Graph(データ可視化ツール)、Concierge, e-Labnote
    >(パーソナルデータベース)を提供している。
    >② Neuroimaging プラットフォーム
    >　ニューロイメージングとは脳の外から脳活動を計測する手法のこと。このプ
    >ラット
    >フォームのXooNIpsでは、インデクスは3層からなり、分野の主題によって分類
    >されている。
    >③ 慶應義塾大学メディアセンターにおけるXooNIps活用事例
    >図書館側からみたXooNIpsの課題は、大量データ処理への対応、図書館コミュニ
    >ティーでの標準メタデータの存在、アーカイブにおける保存と永続性の確保で
    >あった。その対応のためにLibrary module の開発を行い、今回のv3.3へ統合さ
    >れた。
    >今回のワークショップは、図書館が研究者とコラボレーションしながら開発を進
    >める新しいアーカイブシステムの可能性を感じる。
    >④ XooNIpsを活用したサブジェクトリポジトリの構築
    >農林水産研究成果ライブラリ(AGROLib)の検索を可能とし利便性の向上をはかる
    >ために、XooNIpsを導入することとした。13万件以上の論文データがあるが、現
    >在は検索機能を持たず、簡易なメタデータしか付与されてこなかったため。
    >システムの機能要件としては、1)メタデータ入力が容易、2)検索機能の強化、3)
    >メタデータの交換が可能ということがあった。
    >各種システムとの比較検討で、1)導入が容易、2)開発が日本語ベース、3)開発者
    >とのコミュニケーションが取りやすいということがXooNIps採用の決め手となった。
    >平成19年度刊行分から、発行元の研究機関がメタデータを作成し、全文データと
    >共に情報センターに提供するということで合意した。
    >この際、なぜメタデータが必要なのか？という議論が噴出したが、それに対して
    >は、Googleや外のＤＢから検索される機会を増やし、より広く認知されるように
    >するため。ということで納得してもらったとのことである。
    >⑤ 埼玉大学学術情報発信システム(SUCRA)の構築
    >XooNIpsの利用は、リポジトリソフトウェアとしての機能を網羅していること、
    >少ない費用でシステムが構築可能であること、機能拡張が容易であることなどが
    >あげられていた。
    >4. 新バージョン「XooNIps Version 3.30」の紹介
    >新規追加機能は以下の通り。慶應で開発し理研により組込まれた機能(☆)も含ま
    >れている。
    >・ ユーザ登録ワークフローの見直し
    >・ OAI-PMH リポジトリの Set 対応(☆)
    >・ アクセスログのグラフ可視化
    >・ XooNIps管理画面の全面的改訂
    >・ 管理画面からのアイテム一括処理の追加 (☆)
    >・ 管理画面へのシステム設定チェック機能の追加
    >・ ファイルダウンロード時のライセンス同意画面の強化
    >・ アイテム詳細画面における URL の固定化(☆)
    >・ Proxy 設定の追加（OAI-PMH ハーベスタ，PubMed補完，Amazon補完）
    >・ アイテム一覧画面における下層インデックスツリーの表示
    >・ SEO 対策コードの追加(☆)
    >・ XML-RPC API の実装
    >・ ロゴアイコンの更新
    >・ HTML書式違反の修正
    >・ その他累積的なバグおよびセキュリティ問題の修正
    >5. XooNIpsの展望
    >① XooNIpsの機能・性能強化計画
    >今後の開発は、各ユーザからの要望をシステム担当者会議で優先順位を検討し、
    >理研の会議で承認をうけるという流れで行われる。以下は今後対応が計画されて
    >いる機能である。
    >・ユーザアカウント削除機能の整理
    >・アイテムの所有権委譲機能の実装
    >・Binderの改良
    >・グループ領域のアイテム一般公開機能
    >・ユーザインターフェースの品質向上
    >② Concierge連携
    >研究関連のあらゆる資料がデジタルの形式で、研究者のコンピュータに保存され
    >ている。これらの情報を整理し、検索を効率化することが必要であり、そうして
    >おくことによって外との情報の共有も行いやすくなる。開発のポイントは、簡便
    >なインストールと、拡張性を持たせるということであった。XooNIpsにXML-RPC
    >APIが実装されたことを受け、今後はXooNIpsに直接登録できる様な仕組みを開発
    >している。
    >
    >--
    >108-8345 東京都港区三田2-15-45
    >慶應義塾大学メディアセンター本部
    >入江　伸 / 03-5427-1648 / irie ＠ xxxxxxxxxxxxxx
    >

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