低温科学 = Low Temperature Science;第67巻

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光合成遺伝子の同定

横野, 牧生;田中, 亮一;田中, 歩

Permalink : http://hdl.handle.net/2115/39209

Abstract

全ゲノム配列情報が利用できる生物種の数は急速に増加している.次世代シークエンサーの利用などにより,この数は今後ますます増加することが予想される.本章では,この情報を利用した遺伝子の同定法について紹介する.
Recently, the number of available whole genome sequences is rapidly increasing. In order to identify the genes responsible for photosynthesis, we developed a bioinformatics tool, CCCT (Correlation Coefficient Calculation Tool), which calculates the correlation coefficient between the distributions of a certain phenotype and genes among a group of organisms. By using this method, we identified cyanobacterial DVR gene responsible for chlorophyll synthesis. This method can also be applied to the identification of non-photosynthetic genes.

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