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Title: 光合成遺伝子の同定
Other Titles: Identification of genes by using whole genome sequence
Authors: 横野, 牧生1 Browse this author
田中, 亮一2 Browse this author →KAKEN DB
田中, 歩3 Browse this author →KAKEN DB
Authors(alt): Yokono, Makio1
Tanaka, Ryouich2
Tanaka, Ayumi3
Issue Date: 31-Mar-2009
Publisher: 北海道大学低温科学研究所
Citation: 光合成研究法. 北海道大学低温科学研究所, 日本光合成研究会共編
Journal Title: 低温科学
Journal Title(alt): Low Temperature Science
Volume: 67
Start Page: 669
End Page: 672
Abstract: 全ゲノム配列情報が利用できる生物種の数は急速に増加している.次世代シークエンサーの利用などにより,この数は今後ますます増加することが予想される.本章では,この情報を利用した遺伝子の同定法について紹介する.
Recently, the number of available whole genome sequences is rapidly increasing. In order to identify the genes responsible for photosynthesis, we developed a bioinformatics tool, CCCT (Correlation Coefficient Calculation Tool), which calculates the correlation coefficient between the distributions of a certain phenotype and genes among a group of organisms. By using this method, we identified cyanobacterial DVR gene responsible for chlorophyll synthesis. This method can also be applied to the identification of non-photosynthetic genes.
Description: 6章 バイオインフォマティクス 3
Type: bulletin (article)
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Submitter: 低温科学研究所図書室

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